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Test hypergéométrique

Contenu

Titre (dcterms:title)

fr Test hypergéométrique
en Hypergeometric test

Identifiant (dcterms:identifier)

example of usage (obo:IAO_0000112)

<p>Rivals I, Personnaz L, Taing L, Potier MC. (2007) Enrichment or depletion of a GO category within a class of genes: which test ? Bioinformatics. 2007 Feb 15 ;23(4):401-7.&nbsp;http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=17182697</p>

definition (obo:IAO_0000115)

en hypergeometric test is a null hypothesis test which evaluates if a random variable follows a hypergeometric distribution. It is a test of goodness of fit to that distribution. The test is suited for situation aimed at assessing cases of sampling from a finite set without replacements. For instance, testing for enrichment or depletion of elements (e.g GO categories, genes)
fr Le test hypergéométrique est un test d'hypothèse nulle qui évalue si une variable aléatoire suit une distribution hypergéométrique. C'est un test de qualité de l'ajustement à cette distribution. Le test est adapté à une situation visant à évaluer les cas d'échantillonnage à partir d'un ensemble fini sans remplacement. Par exemple, les tests d'enrichissement ou d'épuisement des éléments (par exemple, les catégories GO, les gènes).

editor note (obo:IAO_0000116)

<p>Added following a term request by Chris Mungall :&nbsp;<a href="https://github.com/ISA-tools/stato/issues/6" onclick="window.open(this.href, '', 'resizable=yes,status=no,location=no,toolbar=no,menubar=no,fullscreen=no,scrollbars=yes,dependent=no'); return false;">https://github.com/ISA-tools/stato/issues/6</a></p>

term editor (obo:IAO_0000117)

en Orlaith Burke
en Alejandra Gonzalez-Beltran
en Philippe Rocca-Serra
fr Jean-Marc Meunier

has_specified_output (obo:OBI_0000299)

achieves_planned_objective (obo:OBI_0000417)

R command (obo:STATO_0000041)

<p>phyper(q, m, n, k, lower.tail = TRUE, log.p = FALSE)lower.taillogical; if TRUE (default), probabilities are P[X &le; x], otherwise, P[X &gt; x].</p>

<p>From&nbsp;<a href="http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/stats/html/Hypergeometric.html" onclick="window.open(this.href, '', 'resizable=yes,status=no,location=no,toolbar=no,menubar=no,fullscreen=no,scrollbars=yes,dependent=no'); return false;">http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/stats/html/Hypergeometric.html</a></p>

type (rdf:type)

hierarchy level (md:hierarchyLevel)

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